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Here, we present SingleR, a novel computational method for unbiased cell type recognition of scRNA-seq. SingleR leverages reference transcriptomic datasets of pure cell types to infer the cell of origin of each of the single cells independently.
Puntuación: 4.9/5 ( 66 valoraciones ) El concepto "single" se refiere a una persona que, por la razón que sea, no tiene pareja estable. Algunos singles pueden optar por tener sexo con otras personas,sin que esto conlleve una relación de pareja. Sin embargo, otros pueden optar por llevar una vida de soltería sin sexo.
SingleR is an automatic annotation method for single-cell RNA sequencing (scRNAseq) data (Aran et al. 2019). Given a reference dataset of samples (single-cell or bulk) with known labels, it labels new cells from a test dataset based on similarity to the reference.
SingleR是一个用于对单细胞RNA-seq测序（scRNA-seq）数据进行细胞类型自动注释的R包（Aran et al.2019）。依据已知类型标签的细胞样本作为参考数据集，对测试数据集中的细胞进行标记注释。 一 内置数据库. 使用SingleR的最简单方法是使用内置参考对细胞进行注释。
SingleR is a popular reference-based automatic cell type annotation tool used to predict cell identities from gene expression profiles. We will go step by step through the workflow, including preparing our input data, running SingleR, interpreting the results and some tips and tricks to get the most out of SingleR. You will learn how to:
14 de ene. de 2019 · A novel computational framework for the annotation of scRNA-seq by reference to bulk transcriptomes (SingleR) enabled the subclustering of macrophages and revealed a disease-associated subgroup...
El single es el formato más antiguo desde los inicios de la distribución musical. Inicialmente los sencillos eran vendidos en cilindros de cera para luego darle paso a los vinilos, por ser un material más resistente. Cuando el rock llegó a revolucionar la industria a comienzos de los años 50, los discos se transformaron a 45 rpm ...
