Resultado de búsqueda
28 de nov. de 2023 · The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to sequence databases and calculates the statistical significance of matches.
- Nucleotide BLAST
PSI-BLAST allows the user to build a PSSM (position-specific...
- Needleman-Wunsch
Local alignments algorithms (such as BLAST) are most often...
- Protein BLAST
PSI-BLAST allows the user to build a PSSM (position-specific...
- Nucleotide BLAST
Select the sequence database to run searches against. No BLAST database contains all the sequences at NCBI. BLAST databases are organized by informational content (nr, RefSeq, etc.) or by sequencing technique (WGS, EST, etc.). more...
The NCBI provides a suite of command-line tools to run BLAST called BLAST+. This allows users to perform BLAST searches on their own server without size, volume and database restrictions. BLAST+ can be used with a command line so it can be integrated directly into your workflow.
El BLAST es la herramienta más usada para la anotación y predicción funcional de genes o secuencias proteicas. Muchas variantes han sido creadas para resolver algunos problemas específicos de búsqueda.
Aprende a usar el algoritmo BLAST para comparar una secuencia con una base de datos de millones de secuencias. Descubre cómo se calcula el e-value, el valor de significación estadística de los alineamientos, y cómo interpretar los resultados de un ejemplo de BLAST.
BLAST es el acrónimo de Basic Local Alignment Search Tool. Fué desarrollado por Altschul en 1990 y es el algoritmo mas empleado por el NCBI. La principal característica del BLAST es su velocidad, pudiendo tomar pocos minutos cualquier búsqueda en la totalidad de la base de datos.
El algoritmo BLAST analiza el problema de la búsqueda de bases de datos de secuencias, en donde tenemos una consulta, que es una nueva secuencia, y un objetivo, que es un conjunto de muchas secuencias antiguas, y nos interesa saber a cuál (si alguna) de las secuencias diana es la consulta relacionada.
