Resultado de búsqueda
Por lo general, cuando una nueva secuencia es obtenida, se usa el BLAST para compararla con otras secuencias que han sido previamente caracterizadas, para así poder inferir su función. El BLAST es la herramienta más usada para la anotación y predicción funcional de genes o secuencias proteicas.
BLAST se utiliza habitualmente para comparar una secuencia dada contra toda una base de datos de millones de secuencias. Producen alineamientos locales entre cada pareja de secuencias. Además generan un valor se significación estadística para cada alineamiento.
Búsqueda de secuencias utilizando BLAST¶ La familia de programas BLAST es la más utilizada para buscar secuencias similares en una base de datos dada una secuencia problema.
¿Qué significa BLAST? BLAST es el acrónimo de Basic Local Alignment Search Tool. Fué desarrollado por Altschul en 1990 y es el algoritmo mas empleado por el NCBI. La principal característica del BLAST es su velocidad, pudiendo tomar pocos minutos cualquier búsqueda en la totalidad de la base de datos.
El algoritmo BLAST analiza el problema de la búsqueda de bases de datos de secuencias, en donde tenemos una consulta, que es una nueva secuencia, y un objetivo, que es un conjunto de muchas secuencias antiguas, y nos interesa saber a cuál (si alguna) de las secuencias diana es la consulta relacionada.
28 de nov. de 2023 · Follow NCBI. The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to sequence databases and calculates the statistical significance of matches.
21 de may. de 2023 · ¿Qué es BLAST y para qué sirve? ¿Cuáles son los diferentes tipos de programas BLAST? ¿Cómo determina BLAST la similitud de secuencia? ¿Cuál es la importancia del valor E en los resultados de BLAST? ¿Cómo interpreto los resultados de BLAST? ¿Cómo elijo la base de datos BLAST apropiada para mi análisis? ¿Cuáles son las limitaciones de BLAST?
