Resultado de búsqueda
28 de nov. de 2023 · The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to sequence databases and calculates the statistical significance of matches.
- Nucleotide BLAST
Select the sequence database to run searches against. No...
- Needleman-Wunsch
Local alignments algorithms (such as BLAST) are most often...
- Protein BLAST
PSI-BLAST allows the user to build a PSSM (position-specific...
- Nucleotide BLAST
Select the sequence database to run searches against. No BLAST database contains all the sequences at NCBI. BLAST databases are organized by informational content (nr, RefSeq, etc.) or by sequencing technique (WGS, EST, etc.). more...
El BLAST es la herramienta más usada para la anotación y predicción funcional de genes o secuencias proteicas. Muchas variantes han sido creadas para resolver algunos problemas específicos de búsqueda.
Esta es una recopilación de los comandos que acostumbro a usar al momento de hacer una búsqueda por homología con BLAST. Los ejemplos están hechos en base a un blastn (nucleotídos contra nucleótidos) pero pueden ser adaptados a otros tipos de BLAST según el requerimiento.
El algoritmo BLAST analiza el problema de la búsqueda de bases de datos de secuencias, en donde tenemos una consulta, que es una nueva secuencia, y un objetivo, que es un conjunto de muchas secuencias antiguas, y nos interesa saber a cuál (si alguna) de las secuencias diana es la consulta relacionada.
Aprende a usar el programa BLAST para buscar secuencias similares en una base de datos dada una secuencia problema. Resuelve problemas prácticos sobre anotación, clasificación y diagnóstico de enfermedades con BLAST.
BLAST is a computer algorithm that can rapidly align and compare a query DNA sequence with a database of sequences. Learn how BLAST works, its applications in genomic research, and its history and development.
