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28 de nov. de 2023 · The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to sequence databases and calculates the statistical significance of matches.
- Nucleotide BLAST
PSI-BLAST allows the user to build a PSSM (position-specific...
- Needleman-Wunsch
Local alignments algorithms (such as BLAST) are most often...
- Protein BLAST
PSI-BLAST allows the user to build a PSSM (position-specific...
- Nucleotide BLAST
Select the sequence database to run searches against. No BLAST database contains all the sequences at NCBI. BLAST databases are organized by informational content (nr, RefSeq, etc.) or by sequencing technique (WGS, EST, etc.). more...
Aprende a usar el algoritmo BLAST para comparar una secuencia con una base de datos de millones de secuencias. Descubre cómo se calcula el e-value, el valor de significación estadística de los alineamientos, y cómo interpretar los resultados de un ejemplo de BLAST.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) es un algoritmo y programa informático de alineamiento de secuencias de tipo local, ya sea de ADN, ARN o de proteínas. [1] El programa es capaz de comparar una secuencia problema (también denominada en la literatura secuencia query ) contra una gran cantidad de secuencias que se encuentren en una ...
Aprende a usar el programa BLAST para buscar secuencias similares en una base de datos dada una secuencia problema. Resuelve problemas prácticos sobre anotación, clasificación y diagnóstico de enfermedades con BLAST.
El algoritmo BLAST analiza el problema de la búsqueda de bases de datos de secuencias, en donde tenemos una consulta, que es una nueva secuencia, y un objetivo, que es un conjunto de muchas secuencias antiguas, y nos interesa saber a cuál (si alguna) de las secuencias diana es la consulta relacionada.
BLAST es el acrónimo de Basic Local Alignment Search Tool. Fué desarrollado por Altschul en 1990 y es el algoritmo mas empleado por el NCBI. La principal característica del BLAST es su velocidad, pudiendo tomar pocos minutos cualquier búsqueda en la totalidad de la base de datos.
