Resultado de búsqueda
The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finds regions of local similarity between sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to sequence databases and calculates the statistical significance of matches.
Select the sequence database to run searches against. No BLAST database contains all the sequences at NCBI. BLAST databases are organized by informational content (nr, RefSeq, etc.) or by sequencing technique (WGS, EST, etc.). more...
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) es un algoritmo y programa informático de alineamiento de secuencias de tipo local, ya sea de ADN, ARN o de proteínas. [1] El programa es capaz de comparar una secuencia problema (también denominada en la literatura secuencia query ) contra una gran cantidad de secuencias que se encuentren en una ...
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) utiliza un algoritmo muy rápido basado en palabras (word, k-tuple o kmers) BLAST¶ BLAST se utiliza habitualmente para comparar una secuencia dada contra toda una base de datos de millones de secuencias. Producen alineamientos locales entre cada pareja de secuencias.
BLAST es el acrónimo de Basic Local Alignment Search Tool. Fué desarrollado por Altschul en 1990 y es el algoritmo mas empleado por el NCBI. La principal característica del BLAST es su velocidad, pudiendo tomar pocos minutos cualquier búsqueda en la totalidad de la base de datos.
El algoritmo BLAST analiza el problema de la búsqueda de bases de datos de secuencias, en donde tenemos una consulta, que es una nueva secuencia, y un objetivo, que es un conjunto de muchas secuencias antiguas, y nos interesa saber a cuál (si alguna) de las secuencias diana es la consulta relacionada.
NCBI BLASTP utiliza un umbral predeterminado de 10 para los sinónimos, pero esto puede ser ajustado por el usuario. Usando este conjunto de búsqueda, BLAST escanea rápidamente una base de datos e identifica secuencias de proteínas que contienen dos o más palabras/sinónimos del conjunto de búsqueda.
